中英科学家互助破译形式植物金鱼草的基因组

  L.)也称龙头花(snapdragon),车前科众年生草本植物,因花似金鱼或龙头而得名,是常睹的盆栽、切花及院子抚玩的园艺花草,正在古罗马时间就已竣工了驯化。正在过去的三十年中,金鱼草继续行为分子和发育遗传学的形式作物,许众环节基因是正在金鱼草中被初度觉察,包含MADS家族成员)等。金鱼草中内正在生动的转座子鼓舞了基因的分辩和理解。然而,迄今为止,这些查究都是正在短少基因组序列条目下举办的,无法查究这些基因、转座子和性状的整个进化和遗传机闭。

  今天,中邦科学院遗传与发育生物学查究所薛勇彪查究组共同梁承志查究组、John Innes核心Enrico Coen查究组和华大基因等查究团队,诈骗第二代Illumina基因组测序平台和第三代PacBio单分子测序时间,联结遗传图谱辅助拼装战略,竣工了对栽培金鱼草(Antirrhinum majuscv. JI7)的全基因组序列测定。

  该查究取得了金鱼草(2n=2x=16)8条染色体的分子序列510Mb,掩盖度为97.12%,解释了37714个卵白编码基因,呈报了一个近乎无缺的金鱼草基因组。通过对序列的斗劲理解显示,车前科与茄科正在大约六千二百万年前从其迩来的先人处隔离并正在大约四千六百万到四千九百万年前爆发了全基因组复制事项,该全基因组复制对金鱼草中与花过错称性闭系的TCP基因家族进化具有紧要孝敬。其余,该查究觉察金鱼草的假S位点(ψS-locus)正在大约2Mb的序列上含有102个基因,此中蕴涵37个SLF基因但缺失S-RNase,提示该花柱因子的失落是栽培金鱼草获取自交亲和性状的重要因由,并觉察栽培金鱼草S-位点与野生金鱼草S-位点之间具有高度的共线性。综上,金鱼草基因组的破译将极大加快这个形式生物的基因组学和进化查究。

  该查究结果于2019年1月29日正在线公告正在Nature Plants杂志(DOI:10.1038/s4-9)。薛勇彪查究组李苗苗、张冬芬、张辉,梁承志查究组高强、马斌,中邦科学院北京基因组查究所骆迎峰和华大基因陈春海为本文的配合第一作家,薛勇彪查究员、梁承志查究员、John Innes核心Enrico Coen教导和华大基因尹烨为本文的配合通信作家。该查究取得了中科院战术先导项目、邦度科技部及邦度自然科学基金委的经费援救。

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